Madrasah Aliyah Negeri (MAN) 2 Barito Kuala sudah cukup tua karena nama Madrasah Aliyah Negeri (MAN) adalah peralihan MA Al- Azhar yang didirikan pada tahun 1987, yang penegeriannya berdasarkan KMA Nomor 107 Tahun 1997 tanggal 17 Maret 1997. Kemudian berubah nama menjadi Madrasah Aliyah Negeri (MAN) dengan KMA Nomor 107 Tahun 1997 tanggal 17 Maret 1997 menjadi MAN 2 Marabahan, setelah itu keluar KMA Nomor 671 Tahun 2016 Tanggal 17 November 2016 menjadi MAN 2 Barito Kuala sampai dengan sekarang